Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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