Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms