Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms