Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Usp48Q3V0C5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Usp48Q3V0C5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms