Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms