Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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