Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28047Q3US59 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm28047Q3US59 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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