Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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D13Ertd608eQ3UPR8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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D13Ertd608eQ3UPR8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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