Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms