Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpr55Q3UJF0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpr55Q3UJF0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpr55Q3UJF0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpr55Q3UJF0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpr55Q3UJF0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms