Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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