Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lrrc58Q3UGP9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms