Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Q3U6N9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Q3U6N9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Q3U6N9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms