Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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