Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnf40Q3U319 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rnf40Q3U319 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rnf40Q3U319 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rnf40Q3U319 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rnf40Q3U319 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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