Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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