Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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