Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc10Q3TLI0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms