Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms