Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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