Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V1rd19Q3KNP5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms