Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms