Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms