Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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ptchd1Q14B62 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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ptchd1Q14B62 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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ptchd1Q14B62 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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ptchd1Q14B62 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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ptchd1Q14B62 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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