Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms