Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms