Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms