Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2bQ0KL01 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms