Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms