Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Msx2Q03358 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms