Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EgfrQ01279 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms