Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms