Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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SeleQ00690 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SeleQ00690 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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