Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Itga4Q00651 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms