Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
F8a1Q00558 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms