Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GabpaQ00422 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GabpaQ00422 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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