Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl21cP86793 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms