Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx1P83917 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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