Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms