Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptprn2P80560 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms