Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad50P70388 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad50P70388 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms