Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Snrpd3P62320 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms