Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Snrpd1P62315 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Snrpd1P62315 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Snrpd1P62315 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Snrpd1P62315 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Snrpd1P62315 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Snrpd1P62315 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Snrpd1P62315 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snrpd1P62315 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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