Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga11P61622 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga11P61622 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms