Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sf3b6P59708 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms