Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmoP56726 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmoP56726 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmoP56726 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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