Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lim2P56563 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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