Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

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Length 146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CdaP56389 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CdaP56389 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CdaP56389 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CdaP56389 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CdaP56389 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CdaP56389 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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