Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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