Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa6P50704 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms